二代測序（Next-Generation Sequencing，簡稱NGS）是一種高通量測序技術(shù)，廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。本文將介紹NGS測序的原理和實驗方法。
一、NGS測序原理
NGS測序原理基于DNA片段的擴增和高通量測序技術(shù)。主要步驟如下：
1. 樣品制備：將需要測序的DNA樣品進行提取和純化處理。
2. DNA片段化：將DNA樣品切割成較小的片段。通常采用超聲波或限制性內(nèi)切酶進行切割。
3. 適配體連接：在DNA片段兩端連接適配體，適配體包含特定序列用于后續(xù)連接和測序反應(yīng)。
4. DNA片段擴增：通過PCR或橋式擴增等方法將DNA片段進行擴增，使得每個DNA片段形成數(shù)以百萬計的復(fù)制品。
5. 片段固定：將擴增的DNA片段固定在固定板上。每個DNA片段在固定板上形成一個獨立的簇。
6. 測序反應(yīng)：通過引物識別和鏈延伸等技術(shù)對固定的DNA片段進行測序反應(yīng)。每個DNA片段會在反應(yīng)中逐個添加堿基，并利用熒光信號記錄每個堿基的順序。
7. 圖像捕獲：使用高分辨率攝像機捕獲電荷耦合器件（CCD）上熒光信號的圖像。
8. 數(shù)據(jù)分析：根據(jù)圖像數(shù)據(jù)和序列信息進行測序數(shù)據(jù)的分析和解讀。
二、NGS測序?qū)嶒灧椒?/span>
NGS測序?qū)嶒灠瑯悠分苽?、測序儀器設(shè)置、數(shù)據(jù)采集和數(shù)據(jù)分析等步驟。具體步驟如下：
1. 樣品制備：根據(jù)研究目的選擇合適的樣品，例如細(xì)胞、組織或血清等。將樣品進行DNA提取、純化和片段化處理。
2. 適配體連接：將適配體連接到DNA片段兩端。連接適配體時需要考慮適配體的質(zhì)量和效率，可以選擇商業(yè)化的適配體連接試劑盒。
3. DNA片段擴增：對連接適配體的DNA片段進行擴增。擴增方法可以根據(jù)研究需求選擇PCR、橋式擴增或旋轉(zhuǎn)擴增等技術(shù)。
4. 文庫構(gòu)建：將擴增的DNA片段轉(zhuǎn)化為文庫。文庫構(gòu)建包括文庫準(zhǔn)備、文庫濃度測定等步驟。
5. 測序儀器設(shè)置：根據(jù)實驗需求選擇合適的NGS測序儀器。設(shè)置測序參數(shù)，如測序深度、讀長、文庫密度等。
6. 數(shù)據(jù)采集：將文庫加載到NGS測序儀器中，啟動測序反應(yīng)并將熒光信號采集到計算機中。
7. 數(shù)據(jù)分析：對采集到的圖像和序列數(shù)據(jù)進行質(zhì)量控制、序列比對、變異檢測、拼接等數(shù)據(jù)分析步驟。可以利用商業(yè)化的分析軟件或自行開發(fā)腳本進行數(shù)據(jù)分析。
NGS測序技術(shù)的發(fā)展革命性地改變了基因組學(xué)和其他生命科學(xué)領(lǐng)域的研究方式。其高通量、高效率、低成本的特點使得大規(guī)模測序成為可能，為生命科學(xué)研究提供了更廣闊的應(yīng)用空間。隨著技術(shù)的不斷進步和成本的不斷降低，NGS測序?qū)卺t(yī)學(xué)研究、生命科學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮更加重要的作用。
蘇州阿爾法生物提供的天根試劑盒主要有質(zhì)粒大提、質(zhì)粒小提等各種質(zhì)粒抽提試劑盒、血液DNA提取試劑盒、細(xì)菌DNA提取試劑盒、病毒RNA提取試劑盒、NGS文庫構(gòu)建、植物組織DNA提取試劑盒等各種基因組提取試劑盒。還有DH5感受態(tài)等。
